注意:Gaussian98w の拡張子はデフォルトで"*.out"になっています。 Micro AVSは".log"しか受け付けませんので、".log"に変更してください。
logファイルの"Standard Orientation"の部位から、分子構造モデルを作ります。logファイル内に複数の"Standard Orientation"が存在する場合は、ファイルの一番最後にある"Standard Orientation"を参照します。
データの例
Standard orientation:
----------------------------------------------------------
Center Atomic Coordinates (Angstroms)
Number Number X Y Z
----------------------------------------------------------
1 6 -1.951670 0.122172 -0.003940
2 6 -0.559832 -0.523425 0.004319
3 6 0.561371 0.527456 0.004461
4 6 1.950128 -0.124977 -0.003687
5 1 -2.093244 0.761263 -0.905583
6 1 -2.103807 0.758630 0.897969
7 1 -2.751721 -0.654139 -0.010109
8 1 -0.454249 -1.180960 -0.891451
9 1 -0.461543 -1.172960 0.906978
10 1 0.463873 1.178129 0.906262
11 1 0.458277 1.184514 -0.891823
12 1 2.088022 -0.764713 -0.905938
13 1 2.100180 -0.764253 0.896824
14 1 2.754232 0.647134 -0.010046
---------------------------------------------------------- Standard orientation:
---------------------------------------------------------------------
Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms)
Number Number Type X Y Z
---------------------------------------------------------------------
1 8 0 0.050283 0.692222 0.000000
2 1 0 -0.854814 1.012222 0.000000
3 9 0 0.050283 -0.727778 0.000000
---------------------------------------------------------------------